Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc9Q3U0M1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185 ms