Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp13a5Q3TYU2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms