Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt1Q3TX08 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt1Q3TX08 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms