Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pbxip1Q3TVI8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pbxip1Q3TVI8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms