Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Pnpla6Q3TRM4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pnpla6Q3TRM4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pnpla6Q3TRM4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnpla6Q3TRM4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnpla6Q3TRM4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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