Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Calr4Q3TQS0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Calr4Q3TQS0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms