Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctdnep1Q3TP92 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ctdnep1Q3TP92 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctdnep1Q3TP92 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms