Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLP5

Echdc2, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc2Q3TLP5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Echdc2Q3TLP5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Echdc2Q3TLP5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms