Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cwc27Q3TKY6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cwc27Q3TKY6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cwc27Q3TKY6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cwc27Q3TKY6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cwc27Q3TKY6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms