Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Smarca4Q3TKT4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Smarca4Q3TKT4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Smarca4Q3TKT4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Smarca4Q3TKT4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Smarca4Q3TKT4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms