Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDD9

Ppp1r21, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r21Q3TDD9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp1r21Q3TDD9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r21Q3TDD9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppp1r21Q3TDD9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms