Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl9Q32KG4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms