Protein–RNA interactions for Protein: Q2VLH6

Cd163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, mousemouse

Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd163Q2VLH6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd163Q2VLH6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd163Q2VLH6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd163Q2VLH6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd163Q2VLH6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd163Q2VLH6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd163Q2VLH6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd163Q2VLH6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd163Q2VLH6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd163Q2VLH6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms