Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gbp8Q2V6D6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbp8Q2V6D6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp8Q2V6D6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms