Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam178bQ24JP3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam178bQ24JP3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam178bQ24JP3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam178bQ24JP3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam178bQ24JP3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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