Protein–RNA interactions for Protein: Q14B98

Fam109b, Sesquipedalian-2, mousemouse

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam109bQ14B98 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam109bQ14B98 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam109bQ14B98 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam109bQ14B98 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam109bQ14B98 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam109bQ14B98 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam109bQ14B98 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam109bQ14B98 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam109bQ14B98 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam109bQ14B98 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam109bQ14B98 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms