Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkpd1Q0VF94 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms