Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc39dQ0VF76 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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Ttc39dQ0VF76 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc39dQ0VF76 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc39dQ0VF76 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms