Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpne7Q0VE82 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne7Q0VE82 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms