Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms