Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Vps8Q0P5W1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Vps8Q0P5W1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Vps8Q0P5W1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms