Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Neurl1bQ0MW30 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Neurl1bQ0MW30 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms