Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ttc21bQ0HA38 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Ttc21bQ0HA38 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ttc21bQ0HA38 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ttc21bQ0HA38 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ttc21bQ0HA38 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ttc21bQ0HA38 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ttc21bQ0HA38 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms