Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnnm1Q0GA42 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnnm1Q0GA42 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms