Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SctQ08535 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SctQ08535 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SctQ08535 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SctQ08535 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SctQ08535 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SctQ08535 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SctQ08535 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SctQ08535 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SctQ08535 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SctQ08535 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SctQ08535 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SctQ08535 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SctQ08535 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SctQ08535 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SctQ08535 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SctQ08535 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SctQ08535 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SctQ08535 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SctQ08535 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SctQ08535 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SctQ08535 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SctQ08535 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SctQ08535 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SctQ08535 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SctQ08535 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SctQ08535 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SctQ08535 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SctQ08535 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SctQ08535 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SctQ08535 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SctQ08535 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SctQ08535 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SctQ08535 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SctQ08535 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SctQ08535 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SctQ08535 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SctQ08535 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SctQ08535 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SctQ08535 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SctQ08535 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SctQ08535 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SctQ08535 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SctQ08535 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SctQ08535 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SctQ08535 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SctQ08535 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SctQ08535 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SctQ08535 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SctQ08535 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SctQ08535 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SctQ08535 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SctQ08535 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SctQ08535 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SctQ08535 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SctQ08535 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SctQ08535 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SctQ08535 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SctQ08535 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SctQ08535 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SctQ08535 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SctQ08535 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SctQ08535 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SctQ08535 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SctQ08535 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SctQ08535 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SctQ08535 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SctQ08535 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SctQ08535 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SctQ08535 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SctQ08535 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SctQ08535 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SctQ08535 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SctQ08535 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SctQ08535 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SctQ08535 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SctQ08535 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SctQ08535 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SctQ08535 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SctQ08535 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SctQ08535 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SctQ08535 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SctQ08535 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SctQ08535 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SctQ08535 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SctQ08535 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SctQ08535 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SctQ08535 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SctQ08535 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SctQ08535 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SctQ08535 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SctQ08535 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SctQ08535 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SctQ08535 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SctQ08535 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SctQ08535 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SctQ08535 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SctQ08535 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SctQ08535 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SctQ08535 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms