Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gata4Q08369 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms