Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gdf3Q07104 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms