Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrstQ06666 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrstQ06666 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrstQ06666 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrstQ06666 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrstQ06666 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrstQ06666 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms