Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Aplp2Q06335 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Aplp2Q06335 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Aplp2Q06335 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Aplp2Q06335 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Aplp2Q06335 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Aplp2Q06335 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Aplp2Q06335 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms