Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a1Q05722 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a1Q05722 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a1Q05722 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a1Q05722 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a1Q05722 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a1Q05722 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a1Q05722 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a1Q05722 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a1Q05722 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a1Q05722 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a1Q05722 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a1Q05722 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a1Q05722 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a1Q05722 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a1Q05722 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a1Q05722 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a1Q05722 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms