Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcr5Q04683 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cxcr5Q04683 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcr5Q04683 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.1 ms