Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CkbQ04447 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CkbQ04447 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CkbQ04447 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CkbQ04447 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CkbQ04447 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CkbQ04447 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CkbQ04447 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CkbQ04447 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CkbQ04447 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CkbQ04447 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CkbQ04447 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CkbQ04447 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CkbQ04447 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CkbQ04447 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CkbQ04447 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CkbQ04447 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms