Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RelaQ04207 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelaQ04207 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelaQ04207 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RelaQ04207 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RelaQ04207 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RelaQ04207 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RelaQ04207 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RelaQ04207 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RelaQ04207 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms