Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tff2Q03404 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Tff2Q03404 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tff2Q03404 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms