Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs2Q03350 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms