Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms