Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cacna1sQ02789 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cacna1sQ02789 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna1sQ02789 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms