Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gjb5Q02739 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb5Q02739 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms