Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms