Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VcpQ01853 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VcpQ01853 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VcpQ01853 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VcpQ01853 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VcpQ01853 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VcpQ01853 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VcpQ01853 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VcpQ01853 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VcpQ01853 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms