Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd1Q01822 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms