Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme2Q01768 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms