Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col1a2Q01149 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col1a2Q01149 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.7 ms