Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2cQ01098 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2cQ01098 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grin2cQ01098 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms