Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde1bQ01065 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde1bQ01065 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms