Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VegfaQ00731 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms