Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms