Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
F8a1Q00558 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms