Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cds1P98191 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cds1P98191 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cds1P98191 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cds1P98191 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cds1P98191 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cds1P98191 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cds1P98191 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cds1P98191 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms