Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lama4P97927 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lama4P97927 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lama4P97927 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lama4P97927 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lama4P97927 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Lama4P97927 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lama4P97927 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lama4P97927 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lama4P97927 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lama4P97927 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lama4P97927 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lama4P97927 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lama4P97927 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lama4P97927 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lama4P97927 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lama4P97927 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lama4P97927 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lama4P97927 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lama4P97927 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lama4P97927 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms